गुआनिडाइन थायोसाइनेट का उपयोग बायोमेडिसिन, रासायनिक अभिकर्मकों आदि के रूप में किया जाता है। इसका उपयोग कैओट्रोपिक एजेंट और डिनाट्यूरेंट के रूप में कोशिकाओं को विकृत करने और तोड़ने, आरएनए और डीएनए निकालने और डीएसएससी की रूपांतरण दर में सुधार करने के लिए डीएसएससी के अवशोषक के रूप में किया जा सकता है।